“三證合一”之后，稅務(wù)機關(guān)在管理上面臨著很多細節(jié)問題需要一一解決。作為先行先試地區(qū)的遼寧、浙江和江西等地稅務(wù)機關(guān)總結(jié)了“三證合一”試運行中顯露的問題，并提出解決方案。

　　分支機構(gòu)信息不全怎么辦?

　　遼寧省國稅局的李長偉、本報記者王紅兵反映，新辦理“三證合一”的企業(yè)分支機構(gòu)在辦理完工商部門的相關(guān)業(yè)務(wù)后，相關(guān)信息在傳入國稅、地稅機關(guān)的過程中，無法確認該企業(yè)的企業(yè)所得稅主管稅務(wù)機關(guān)。他們建議，在企業(yè)提供資料中或在信息采集表中，應(yīng)提供或填寫總機構(gòu)的企業(yè)所得稅所屬稅務(wù)機關(guān)情況，以便核定稅種時確定企業(yè)所得稅的管理機關(guān)，避免出現(xiàn)漏管現(xiàn)象。

　　部分企業(yè)不做備案怎么辦?

　　遼寧省國稅局的李長偉、本報記者王紅兵反映，“三證合一”后，存在部分企業(yè)不到稅務(wù)機關(guān)進行備案的情況。他們建議，在推行“三證合一”的工作中，應(yīng)加強部門間的配合，及時做好相關(guān)資料的整合補充和修訂。例如，適度增加行政部門內(nèi)部的文書傳遞等。

　　傳輸技術(shù)不成熟怎么辦?

　　浙江省常山縣國稅局的曾水華反映，目前傳輸技術(shù)不太成熟，需內(nèi)外網(wǎng)雙線運行傳輸數(shù)據(jù)，以致各登記部門工作量不降反升。他建議，統(tǒng)一設(shè)置工商登記信息采集表。將稅務(wù)、工商、質(zhì)監(jiān)、社保等部門需要企業(yè)提供的相關(guān)信息，由企業(yè)辦理營業(yè)執(zhí)照時一次性提供，工商統(tǒng)一接收、審核、掃描紙質(zhì)資料，取消稅務(wù)、質(zhì)監(jiān)、社保再審核環(huán)節(jié)，以提高辦證速度和工作效率。只要確保企業(yè)登記的聯(lián)系方式正確，各相關(guān)部門遇有疑問或需補充、更新相關(guān)登記信息時，可以聯(lián)系企業(yè)進行確認和補正。

　　電子檔案管理薄弱怎么辦?

　　浙江省常山縣國稅局的曾水華反映，實現(xiàn)“三證合一”后，稅務(wù)機關(guān)不再收取企業(yè)紙質(zhì)登記資料，全面接收工商掃描的電子登記資料。因此，加強電子檔案管理被提上重要議事日程。保管電子檔案可方便查詢和使用，但對電子檔案管理工作的要求提高，需提升檔案人員整體素質(zhì)。

　　企業(yè)登記信息識別難怎么辦?

　　江西省宜春市地稅局的伍青蓮、喻高松反映，工商登記制度改革放寬和簡化了對住所及注冊資本登記等方面的管理要求，但給稅務(wù)登記信息的完整性和真實性帶來影響。他們建議，一是信息互換溝通應(yīng)到位，把好市場主體準入資料關(guān)。這方面，工商窗口能否把好資料審核關(guān)對稅務(wù)機關(guān)的后續(xù)管理至為重要。同時，稅務(wù)機關(guān)應(yīng)梳理出需要納稅人提供的涉稅資料，如公司章程、投資股東構(gòu)成及投資比例等。二是后續(xù)明責梳理應(yīng)及時，把住企業(yè)登記關(guān)。“三證合一”對稅務(wù)機關(guān)后續(xù)管理提出新要求，必須盡快調(diào)整優(yōu)化征管流程。例如，應(yīng)明確納稅服務(wù)分局、各管理分局和市局征管科室的職責。宜春市地稅局實行了先實地核查再確定是否審核通過的工作機制，及時識別了一些虛假登記行為，并提請工商部門吊銷營業(yè)執(zhí)照，在一定程度上控制了虛假登記戶和零申報戶的增長。